Periodicamente Il Museo pubblica volumi dedicati a temi scientifici d’interesse, messi a disposizione del pubblico presso la reception. Sono disponibili:

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Collana I Quaderni, Edizioni Scientifiche del Museo, voll. III (1985) e V (1998)
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Guida al Museo. L’Alca, Museo Civico di Paleontologia e Paletnologia “Decio de Lorentiis” di M. A. Orlando, ed. Amministrazione com. Maglie, 2003
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Le scienze geo-archeologiche e bibliotecarie al servizio della Scuola, Pubblicazioni Scientifiche del Museo Civico di Maglie, a cura di M. A. Orlando, ed. Kollemata, Monteroni, 2005
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L’Uomo e la Pietra nel Salento preistorico, Pubblicazioni Scientifiche del Museo Civico di Maglie, a cura di M. A. Orlando, ed. Amministrazione com. Maglie, 2007.
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